Marcos Carbajal, Pool

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    Item type:Publicación,
    Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Peru from 2020 to 2024
    (Springer Nature, 2026)
    Sobkowiak, Benjamin
    ;
    Langdon, Amy E.
    ;
    Romero, Pedro E.
    ;
    Carrasco-Escobar, Gabriel
    ;
    Villa, Diego
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    Item type:Publicación,
    Efluentes hospitalarios como reservorio de enterobacterias productoras de betalactamasas y carbapenemasas
    (2021-04-14)
    David R. Soriano‐Moreno  
    ;
    José Yareta-Yareta  
    ;
    Ana F. Rojas-Cosi
    ;
    Alexander Fajardo-Loyola
    ;
    Diana León-Luna
    The aim of this study was to determine the presence of beta-lactamase- (bla) producing Enterobacteriaceae in hospital effluent samples from two level II and III hospitals in Lima, Peru. The resistance profile of the isolated bacteria was identified and characterized using the MicroScan system for 18 antimicrobials, and the presence of extended spectrum beta-lactamases (ESBL) (blaCTX-M ,bla SHV bla TEM ,bla PER) and carbapenemases (bla KPC ,bla NDM ,bla VIM ,bla IMP) resistance genes was determined by conventional PCR. Thirty-two isolates were identified (20 Enterobacteriaceae and 12 gram-negative bacteria). All the isolated bacteria showed multidrug resistance. ESBL (bla TEM) and carbapenemase (blaKPC, blaIMP) genes were found in samples from the hospitals that we evaluated. The release of these microorganisms to public areas and the lack of treatment of the hospital effluents could be an important public health problem.
    Citas (OpenAlex): 8
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    Item type:Publicación,
    Características moleculares de aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae resistentes a antibióticos obtenidos de muestras de orina de pacientes con infección del trato urinario en Lima y Callao, Perú
    (2023-07-21)
    Alexander Fajardo-Loyola  
    ;
    José Yareta-Yareta  
    ;
    Henry Meza-Fernández
    ;
    Javier Soto Pastrana
    ;
    Pool Marcos-Carbajal  
    Introducción. Las infecciones del tracto urinario son la segunda enfermedad más frecuente causada por bacterias, principalmente por E. coli y K. pneumoniae; además la aparición de bacterias multidrogorresistentes productoras de Betalactamasas de espectro extendido (BLEE) representa un serio problema de salud pública. Objetivos. Describir las características moleculares de aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de BLEE obtenidos de muestras de orina de pacientes peruanos con infección del tracto urinario (ITU). Materiales y métodos. Estudio retrospectivo transversal descriptivo. Se analizaron 118 aislamientos de urocultivos de pacientes con ITU atendidos en 2 hospitales de la provincia de Lima y 1 de la provincia del Callao procesados entre abril y agosto del 2019. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes BLEE se empleó una PCR convencional. Resultados. El 100% de las bacterias aisladas en los tres hospitales fueron multidrogorresistentes (105 E. coli y 13 K. pneumoniae). La coexistencia de genes BLEE (blaTEM, blaCTX-M, blaSHV) se observó en 32.20% de los aislamientos (28.57% de los E. coli y 61.53% de los K. pneumoniae), hallándose coexistencia de 2 genes y 3 genes en 12.71 % y 21.18 %, respectivamente; además, blaTEM fue el gen BLEE más frecuentemente expresado en los aislamientos (45.76%). Conclusiones. Se halló multidrogoresistencia en todos los aislamientos analizados. Además, se observó coexistencia de genes BLEE en casi un tercio de todos los aislamientos, lo que evidencia que la resistencia a los antibióticos es una problemática real en los hospitales públicos del Perú.
    Citas (OpenAlex): 1
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    Item type:Publicación,
    The role of the microbiome in the development, progression and treatment of cancer
    (2024-04-29)
    Instituto de Investigación en Ciencias Biomédicas, Facultad de Medicina Humana, Universidad Ricardo Palma. Lima, Perú  
    ;
    Mariana Callapiña-De Paz
    ;
    Pool Marcos-Carbajal  
    ;
    Médico cirujano
    ;
    Magister en biología molecular
    Se tiene conocimiento que existe gran variedad de poblaciones extensas y diversas de bacterias, virus y hongos ocupando cada superficie del cuerpo (1). Se estima que hay casi 30 trillones de células bacterianas viviendo dentro de cada ser humano, y existe una diversidad genética 100 veces más alta de las bacterias, lo que codifica capacidades metabólicas que influyen en su ecosistema microbiano y en el sistema inmunológico especifico del tejido del huésped (2). Estos microbios son conocidos de manera colectiva como la microbiota humana, mientras que el conjunto de microoganismos, genes y metabolitos que habitan un determinado lugar son conocidos como el microbioma (3).
    Citas (OpenAlex): 0metric-badges.view 1
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    Item type:Publicación,
    Detección de virus influenza A, B y subtipos A (H1N1) pdm09, A (H3N2) por múltiple RT-PCR en muestras clínicas
    (2017-06-30)
    Pool Marcos-Carbajal  
    ;
    Maribel Huaringa
    ;
    Nancy Rojas
    ;
    Victoria Gutiérrez
    ;
    Sila Ruiton
    OBJECTIVES.: To describe the clinical and epidemiological characteristics of patients diagnosed with epidermolysis bullosa (EB) at the Instituto Nacional de Salud (INSN) in Lima, Peru; a National Reference Center for this disease. MATERIAL AND METHODS: . Observational, descriptive and transversal study. We reviewed the clinical histories and laboratory tests of patients diagnosed with EB treated in INSN from 1993 to 2015. RESULTS.: 93 patients were registered. The average age was 7.9 ± 5.6 years; 53.8% (n = 50) were boys. Clinical forms corresponded to dystrophic EB with 41 (44.1%) cases, simple EB with 39 (41.9%) union EB cases with 8 (8.6%) and Kindler syndrome with 4 (4.3%) cases. The clinical form could not be identified in a case. A total of 48 cases (51.6%) came from Lima and Callao, and 45 cases (48.4%) from other provinces of the country. Extracutaneous manifestations involved gastrointestinal (44.1%), ocular (37.6%), odontogenic (87.1%), and nutritional (79.6%) involvement, as well as pseudosindactilia (16.1%). Chronic malnutrition (71.6%), acute malnutrition (17.6%) and anemia (62.4%) were found. Mortality corresponded to 6 cases (6.5%). CONCLUSIONS.: 93 cases of EB were reported in INSN, the predominant clinical presentation was the dystrophic form.
    Citas (OpenAlex): 8metric-badges.view 1
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    Item type:Publicación,
    Cambios en la microbiota intestinal en neonatos pretérmino en un hospital de tercer nivel en Perú
    (2022-06-15)
    Lissette Flores de Valgas-Velez  
    ;
    Natali Huzco-Rutti
    ;
    Pool Marcos-Carbajal  
    Introducción: La Microbiota Intestinal (MI) del recién nacido pretérmino (RNP) es modificada por factores como la hospitalización, los antibióticos, la nutrición post natal, entre otros. El estudio: Investigación observacional – longitudinal con objetivo de analizar los cambios en la MI promovidos por el tipo de lactancia recibida en neonatos <37 semanas de edad gestacional. Se analizaron muestras de 23 neonatos hospitalizados en las Unidades de Cuidados Intensivos (UCIN) y Neonatología. Hallazgos: No se encontró diferencia significativa en el desarrollo de la MI respecto al tipo de alimentación, sin embargo se observó una tendencia diferente entre los neonatos alimentados con Leche Humana (LH) que aumentaron la cantidad de Lactococcus y Clostridium mientras disminuyeron Lactobacillus, opuesto al grupo alimentado con Lactancia Mixta (LM) que aumentó la abundancia de Lactobacillus y disminuyó Lactococcus y Clostridium; Conclusión: Se concluye que los miembros específicos de la MI del RNP depende de la interacción dinámica entre el huésped y el tipo de selección dietética.
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    Item type:Publicación,
    Distribución por procedencia y altitud del polimorfismo RS5522 del gen NR3C2 receptor de mineralocorticoide en poblaciones peruanas
    (2024-06-24)
    Pool Marcos-Carbajal  
    ;
    Christian Allca-Muñoz
    ;
    Eduardo Barbosa-Coelho
    ;
    José Sandoval-Sandoval
    ;
    Alberto Salazar‐Granara
    Objetivo: Determinar la distribución del polimorfismo RS5522 del gen NR3C2 receptor de mineralocorticoide según su procedencia y altitud en poblaciones peruanas. Materiales y métodos: Tras firmar el consentimiento informado, participaron adultos procedentes de Lima (22), Ica-Chincha (14), Lambayeque-San José (16); Puno-Uros (10), Puno-Taquile (6), Puno-Amantani (6), Arequipa-Chivay (10), Arequipa-Cabanaconde (6), Ancash-Parobamba (20), Apurímac-Andahuaylas (10), Apurímac-Abancay (10), Cajamarca-Puentecillos (13), Cajamarca-Ichocan (7), Loreto-Andoas (16), y San Martín-Lamas (22). Se colectó datos epidemiológicos y geográficos, muestra biológica sanguínea y/o por hisopado bucal. La extracción de ADN se realizó mediante técnica estándar. La determinación del polimorfismo RS5522 fue mediante PCR en tiempo real. Se categorizó variables por procedencia, región geográfica (costa, sierra o selva), y altitud (<2500 msnm o ≥2500 msnm). Se aplico la prueba estadística de Hardy Weimberg, y la prueba X2 de Pearson, siendo significativo un valor p<0.05 para un IC al 95%. Resultados: Se presento alta frecuencia de la variante RS5522 del gen NR3C2 en poblaciones peruanas. Los rangos de distribución en la Costa, Sierra y Selva, respectivamente fueron de 78.57-87.50%, 50.00-93.75%, y 75.00-93.18%. Acorde a la altitud el rango de distribución a <2500 msnm fue de 75.00-93.18%, y ≥2500 msnm fue de 50.00-93.75%. Conclusiones: Se observo una distribución heterogénea de la variante genética entre las sub poblaciones peruanas estudiadas, siendo aparentemente mayor para las ubicadas en la región de la sierra y a ≥2500 msnm, resaltar que la variante genética estudiada codifica para una proteína con importante rol fisiológico, y también como blanco de fármacos.
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    Item type:Publicación,
    Genes resistentes a carbapenémicos y colistina aislados en <i>Musca domestica</i> proveniente de un basural cercano a un hospital de Lima
    (2024-06-21)
    Miguel A. Alarcón-Calle  
    ;
    Víctor L. Osorio-Guevara
    ;
    Ramsés Salas Asencios
    ;
    José Yareta-Yareta  
    ;
    Pool Marcos-Carbajal  
    Motivation for the study. The presence of antibiotic resistance genes in bacteria isolated from common flies is a potential public health hazard because it facilitates the presence and spread of antibiotic resistance genes in the environment. Main findings. Thirty-eight bacterial strains identified in 14 species were isolated from within the fly bodies, of which 31 strains showed resistance to carbapenems and 26 strains showed resistance to colistin. Seven bacterial strains showed carbapenem resistance genes and one Escherichia coli strain had resistance to KPC, OXA-48 and mcr-1. Implications. This is the first report of antibiotic resistance genes in bacteria carried by common flies in Peru. The objective was to determine the presence of carbapenem resistance genes and plasmid resistance to colistin (mcr-1) in bacteria isolated from Musca domestica in a garbage dump near a hospital in Lima, Peru. Bacteria with phenotypic resistance to carbapenemics were isolated on CHROMagar mSuperCARBATM medium and colistin resistance profiling was performed using the colistin disk elution method. Detection of blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaOXA-48, blaVIM and mcr-1 genes was performed by conventional PCR. The antimicrobial susceptibility profile was determined using the automated MicroScan system. We found that 31/38 strains had phenotypic resistance to carbapenemics and 26/38 strains had phenotypic resistance to colistin with a minimum inhibitory concentration ≥ 4 µg/ml. Finally, we identified seven bacterial strains with carbapenem resistance genes (OXA-48 and KPC) and one bacterial strain with plasmid resistance to colistin (mcr-1). One Escherichia coli strain had three resistance genes: KPC, OXA-48 and mcr-1.
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    Citas (OpenAlex): 3
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    Item type:Publicación,
    Acción antibacteriana de extractos corteza de Maytenus macrocarpa (Chuchuhuasi) contra cepas ATCC de Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus
    (2023-09-15)
    Pool Marcos-Carbajal  
    ;
    Christian Allca-Muñoz
    ;
    Juan Carlos Castro-Sánchez
    ;
    Luis Felipe Segura-Chavez
    ;
    Alberto Salazar‐Granara
    El aumento de infecciones comunitarias como las hospitalarias a causa de infecciones por bacterias con resistencia a múltiples drogas antibióticas. Constituyen en la actualidad como uno de los problemas de mayor preocupación en salud pública global, generando la necesidad de poder encontrar nuevas alternativas terapéuticas, siendo así que se ha ampliado la búsqueda a través de los principios activos en plantas con efecto antimicrobiano. Maytenus macrocarpa ̈Chuchuhuasi ̈ es un árbol nativo de la región Amazónica del Perú utilizado como analgésico, antiinflamatorio y antioxidante. Este árbol se caracteriza por contener compuestos activos como triterpenoquinonas y dímeros triterpénicos los cuales pueden presentar actividad antimicrobiana. El objetivo del presente estudio fue determinar la acción antimicrobiana de flavonoides y alcaloides de Maytenus macrocarpa, contra las cepas de Pseudomonas aeruginosa ATCC 25923 y Escherichia coli ATCC 25922, determinándose la actividad antimicrobiana de los extractos mediante el método Kirby Bauer. Se encontró que las cepas de Pseudomonas aeruginosa ATCC 25923 y Escherichia coli ATCC 25922 fueron resistentes a todos los extractos de Maytenus macrocarpa, siendo sensible la cepa de Staphylococcus aureus ATCC 25923. Se concluye que los extractos de Maytenus macrocarpa no presentan actividad antimicrobiana frente a cepas gram negativas, pudiendo ser considerada una buena opción terapéutica frente a cepas gram positivas. Palabras Clave: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Antibacterianos, Maytenus, Extractos vegetales (fuente: DeCS BIREME)
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